《我的武林男友》講述一個古今穿梭的故事，有點現代版《尋秦記》的味道，只不過將重心放在了現代部分。故事緣起於一千年前的武林奇才少年米倉被陰險的師叔陸宏開追殺，在時光隧道前，米倉跌進2004年，陸宏開則闖入2002年的世界，在現代社會兩個古人又同時愛上的性格可愛直率的現代女孩cary，一段古今情就此展開……
　　米倉幼年時家破人亡，全都是因為走入邪路的師叔陸宏開為了強搶米倉父母所藏有的本門秘籍，決意下毒手血洗米家。幸虧米倉父親的大師兄左無嗔趕到，將襁褓中的米倉救出，也保全了米倉父親的秘笈。不料陸宏開逃走之前，卻意外發現米倉和他一樣，也是個身帶'金命”、擁有稱霸武林素質的人！
　　左無嗔將米倉救出之後，將他收為弟子，而左無嗔的獨生女兒阿細從小就被扮成男孩模樣和父親行走江湖，也順理成章的成了米倉的師弟。轉眼兩人都長成了英俊少年，左無嗔卻一直未曾將米倉的身世和上一代的恩怨告訴他。但當他發現自己死期已近時，終於告知米倉這一切，不料潛伏多時的陸宏開竟在此時闖入……危急時刻，米倉和阿細遵照師父窮盡一生的推算，在滿月夜裡，循著燭滅之處，當真碰見了一場百年星雨，時空缺口乍然出現……